มหาวิทยาลัยราชภัฏอุบลราชธานีได้รับเตรียมการก่อตั้งขึ้นครั้งแรกในฐานะเป็นโรงเรียนฝึกหัดครูชั้นต้นประจำมณฑล เมื่อวันที่ 26 พฤษภาคม 2458 ภายใต้การดูแลของโรงเรียนเตรียมอุดมศึกษา จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย หลังจากนั้นก็ได้รับการพัฒนาให้เป็นสถาบันการศึกษาด้านการฝึกหัดครูและพหุสาขาวิชามาอย่างต่อเนื่องจนกระทั่งได้รับการยกฐานะเป็นมหาวิทยาลัยราชภัฏอุบลราชธานีในปี พ.ศ. 2547 จนถึงปีปัจจุบัน นับว่าเป็นมหาวิทยาลัยราชภัฏที่เก่าแก่ที่สุดแห่งหนึ่งของประเทศไทย
การจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาของมหาวิทยาลัยราชภัฏอุบลราชธานี มีพัฒนาการมาจากพระราชบัญญัติสถาบันราชภัฏ พ.ศ. 2538 ที่ยกฐานะวิทยาลัยครูอุบลราชธานีขึ้นเป็นสถาบันราชภัฏอุบลราชธานี ในช่วงนั้นได้ริเริ่มบุกเบิกเพื่อเปิดสอนระดับปริญญาโทและนับเป็นสถาบันราชภัฏแห่งแรกในบรรดาสถาบันราชภัฏทั่วประเทศที่ทำการเปิดสอนระดับบัณฑิตศึกษา (ปริญญาโท) โดยมหาวิทยาลัยได้พัฒนาหลักสูตร ข้อบังคับ ระเบียบ และประกาศที่เกี่ยวข้องกับการจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาของมหาวิทยาลัยเอง ทั้งนี้เพราะสถาบันราชภัฏอุบลราชธานีในเวลานั้น ได้พิจารณาเห็นว่า สถาบันได้มีประสบการณ์ในจัดการศึกษาระดับอนุปริญญาและปริญญาตรีมาอย่างต่อเนื่องเป็นเวลาหลายสิบปี จึงสมควรที่จะขยายโอกาสทางวิชาการและการให้บริการการศึกษาแก่คนในท้องถิ่น โดยการเปิดสอนในระดับที่สูงกว่าปริญญาตรี ในระยะแรกได้เปิดสอนหลักสูตรครุศาสตรมหาบัณฑิตขึ้นในปี พ.ศ. 2540 จำนวน 3 สาขาวิชา ได้แก่ สาขาวิชาการบริหารการศึกษา สาขาวิชาวิจัยและประเมินผลการศึกษา และสาขาวิชาการพัฒนาหลักสูตรและการเรียนการสอน